Inspektorzy pochwalili fundusze zarządzające finansami oraz ich koordynatora - czyli Komitet Integracji Europejskiej. Polska w latach 1998-99 otrzymała z Komisji Europejskiej ponad 12 milionów EURO. Według NIK przeszło 80 procent zostało wydanych na właściwe cele. O ile jednak pieniądze z funduszu PHARE wydali szybko i zgodnie z przeznaczeniem, to już tak dobrze nie poradzono sobie z funduszami ISPA i SAPART. W samym Komitecie Integracji Europejskiej kontrolerzy odkryli, że gdzieś "zawieruszyły" się komputery o wartości 4 milionów złotych które KIE dostał od Komisji Europejskiej. Jak dotąd nie udało się ustalić co się z nimi stało. - Gdzie one są tego nie można dokładnie powiedzieć, ponieważ nie ma inwentaryzacji. Była prowadzona inwentaryzacja, z której nie sporządzono protokołu. Dopiero w trakcie prowadzenia kontroli wprowadzono zasadę rozliczania użytkowników przy podpisaniu obiegówek. Jednym słowem bałagan totalny w tym zakresie - powiedział Jacek Uczkiewicz, wiceprezes NIK. Inspektorzy NIK skierowali sprawę do prokuratury w związku z podejrzeniem popełnienia przestępstwa.