Na mocy decyzji sądu generał Sener Eruygur, były dowódca paramilitarnej żandarmerii i generał Hursit Tolon, były dowódca stacjonującej w regionie egejskim 1. Armii, przebywają obecnie w więzieniu w Stambule. Eruygur jest przewodniczącym Stowarzyszenia Myśli Kemalistowskiej, które w ubiegłym roku pomagało organizować masowe demonstracje antyrządowe. Według tureckich mediów, obu generałów podejrzewa się o przynależność do skrajnie nacjonalistycznego ugrupowania Ergenekon, stawiającego sobie za cel utrzymanie świeckiego charakteru państwa. Rządząca obecnie w Turcji Partia Sprawiedliwości i Rozwoju (AKP) wywodzi się z ideologii islamistycznej. Natomiast siły zbrojne i ich kadra dowódcza uważane są za strażników republikańskiego sekularystycznego dziedzictwa twórcy współczesnego państwa tureckiego Kemala Atatuerka. Pod zarzutem współpracy z Ergenekon aresztowano już dziesiątki ludzi, wśród których są emerytowani oficerowie. Przeciwnicy rządu wskazują, iż trwające już 13 miesięcy śledztwo w sprawie domniemanych przygotowań do puczu nie przyniosło żadnych konkretnych rezultatów.