Pięciu pozostałych oskarżonych otrzymało wyroki od 15 do 22 lat więzienia. Proces Milutinovicia i jego współoskarżonych rozpoczął się w 2006 roku. Zarzuty dotyczyły przymusowej deportacji około 800 tys. cywilów oraz zamordowania setek cywilów przez siły serbskie w Kosowie w latach 1998-99. Milutinović został oskarżony równocześnie z dawnym przywódcą Jugosławii Slobodanem Miloszeviciem. Był ostatnim prominentnym członkiem dawnego reżimu, który zachował stanowisko po obaleniu Miloszevicia w 2000 roku. Oddał się dobrowolnie w ręce trybunału haskiego w styczniu 2003 roku, po wygaśnięciu pięcioletniego mandatu prezydenta Serbii.