Decyzja w sprawie śledztwa ma związek z ubiegłorocznym raportem amerykańskiego Senatu, który opisywał tortury stosowane na więźniach, a także szczegóły dotyczące poszczególnych tajnych ośrodków CIA. Dokument nie wskazywał jednak konkretnie lokalizacji więzień.Według rzeczniczki litewskiej Prokuratury Generalnej, ujawnione w amerykańskim raporcie informacje pasują do doniesień o tym, że na Litwie znajdowało się więzienie CIA. Śledczy sprawdzą, czy nie złamano dwóch artykułów kodeksu karnego - o nielegalnym transporcie obcokrajowca przez granicę litewską, a także o nadużyciu władzy przez przedstawiciela państwa. Od lutego litewscy śledczy prowadzą dochodzenie w sprawie domniemanego uwięzienia w tajnym ośrodku CIA obywatela Arabii Saudyjskiej. Organizacje broniące praw człowieka, a także prawnicy więzionych przez USA podejrzanych o terroryzm twierdzą, że Litwa była jednym z kilku państw Europy Środkowo-Wschodniej, gdzie znajdowały się tajne ośrodki. Ich zdaniem, w tej grupie była też Polska. Więzienie miało się znajdować w latach 2002-2005 w Starych Kiejkutach na Mazurach. Zarówno litewskie, jak i polskie władze dotąd nie przyznały oficjalnie, że na ich terytoriach CIA przetrzymywała podejrzanych o terroryzm.