Będą także ściśle współpracować w kontrowersyjnych kwestiach dotyczących inżynierii genetycznej oraz w walce z epidemiami dotykającymi zwłaszcza kraje rozwijające się. Nie udało się im jednak osiągnąć porozumienia w kontrowersyjnych kwestiach ekonomicznych. Unia zarzuca Waszyngtonowi nieuczciwe wykorzystywanie sankcji handlowych. Przewodniczący komisji Europejskiej, Romano Prodi zapowiedział, że rozwiązaniem sporów zajmie się w takiej sytuacji Światowa Organizacja Handlu. - Opowiadaliśmy się i nadal opowiadamy za wielostronnym systemem handlowym. Wszystkie główne dysputy w tej dziedzinie, a jest ich trzy, zostaną szczegółowo rozpatrzone i rozwiązane zgodnie z zasadami Światowej Organizacji Handlu. To najlepsze wyjście - powiedział Prodi.