W hierarchii służbowej Pentagonu zajmuje on drugie miejsce, po szefie resortu Robercie Gatesie. Lynn zgodził się z opinią republikańskiego senatora i niedawnego kandydata na prezydenta Johna McCaina, iż w odniesieniu do Phenianu Waszyngton powinien się przygotować na "najgorszy scenariusz". Występujący na forum komisji sił zbrojnych Senatu przedstawiciele Pentagonu powiedzieli, że Korea Północna rozwija swą technikę rakietową we współpracy z innymi państwami, w tym z Iranem i potencjalnie Syrią.