Bongo zmarł z powodu zatrzymania akcji serca. Zgon nastąpił około południa, w kilka godzin po informacjach z urzędu prezydenta, że Bongo żyje i ma się dobrze. Tygodnik "Le Point" w niedzielę informował na swej stronie internetowej, powołując się na nieokreślone bliżej źródło z otoczenia prezydenta Gabonu, że Bongo zmarł na raka w wieku 73 lat. Informację tę powtórzyły inne francuskie media. Omar Bongo Ondimba doszedł do władzy w 1967 roku.