Po mszy żałobnej w katedrze Sw. Szczepana w Wiedniu, zwłoki Habsburga i jego żony Reginy von Sachsen-Meiningen, która zmarła w Niemczech w 2010 roku zostały wprowadzone do rodzinnej krypty Kościoła Kapucynów, w której spoczywa matka Ottona - cesarzowa Zyta. Zgodnie z kilkusetletnią tradycją kondukt żałobny przeszedł śródmieściem Wiednia ponad dwu i półkilometrową trasą, okrążając Pałac Cesarski. Potem kondukt zatrzymał się przed wejściem do Kościoła Kapucynów na Neuermarkt, gdzie od 1663 roku chowano austriackich cesarzy i członków rodziny panującej. Wprowadzenie zwłok do krypty Habsburgów przebiegło również zgodnie z tradycją. Przeor kościoła zadał pytanie: "Kto chce wejść ?". Odpowiedź, którą przekazano w imieniu zmarłego, brzmiała: "Jego Wysokość Otto von Habsburg - Cesarz Apostolski, Król Węgier, Król Czech, Moraw, Dalmacji, Chorwacji, Galicji, Lodomerii (....) apostolski król Jerozolimy, wielki Książę Krakowa i arcyksiążę Austrii". Przeor okazał się jednak nieugięty: "Nie znam takiego" - odparł. Wówczas padła kolejna prośba: "Biedny grzesznik, który prosi o miłosierdzie Boże". "Możesz wejść" - odpowiedział przeor. W ceremonii pogrzebowej wzięło udział ponad 1000 zaproszonych polityków, koronowanych głów i szefów rządów krajów Unii Europejskiej. Za trumną szły tłumy wiedeńczyków. Na Placu Bohaterów podczas przemarszu konduktu oddano 12 salw armatnich. Urodzony w 1912 r. Otto Habsburg miał objąć tron po swoim ojcu Karolu I, ale po rozpadzie monarchii w 1918 r. żył na emigracji. W latach 50. osiadł w Bawarii, gdzie działał jako pisarz i polityk. Po przyjęciu obywatelstwa niemieckiego został członkiem chadeckiej CSU. Ten poliglota i wielki zwolennik integracji europejskiej od 1979 do 1999 r. zasiadał w Parlamencie Europejskim. Na całym świecie wygłaszał wykłady na temat spraw międzynarodowych. - Otto Habsburg zawsze wiedział, że na europejskim kontynencie więcej nas łączy niż dzieli. To jego najważniejsze dla nas przesłanie - powiedział przewodniczący Parlamentu Europejskiego Jerzy Buzek, który wziął udział w ceremonii pogrzebowej. Szef PE nazwał Otto Habsburga "zaangażowanym Europejczykiem". W ostatnich dniach austriackie czasopisma były wypełnione opowieściami o dynastii Habsburgów, okraszonymi wspomnieniami prominentnych polityków i ludzi biznesu. Jego śmierć wywołała w Austrii nostalgię za złotymi latami monarchii austro-węgierskiej, która rozpadła się w 1918 roku.