Paksas jest oskarżany między innymi o uwikłanie się w konflikt interesów prywatnych i służbowych, brak dbałości o ochronę tajnych informacji i bezprawne ingerowanie w działalność prywatnych firm. Litewski Sejm przekazał do sądu konstytucyjnego wnioski specjalnej komisji, która już orzekła, że Paksas naruszył konstytucję i złamał prezydencką przysięgę. Tymczasem Paksas uważa, że oskarżenia są absurdalne, a wszczęta przeciw niemu procedura impeachmentu (pozbawienia władzy) to rezultat przemyślanej kampanii, za którą stać ma m.in.przewodniczący Sejmu, Arturas Paulauskas. Data głosowania nad ewentualnym odsunięciem Paksasa od władzy zostanie ustalona na początku marca.