Ogień, jaki z niewiadomych powodów pojawił się przed świtem, strawił całą drewnianą budowlę, wraz z pochodzącą sprzed wieków figurą opiekuna dzieci oraz ponad 60 tysiącami starożytnych figurek, tradycyjnie prezentowanych tu przez rodziców i dzieci bogom-strażnikom najmłodszych. Jakko-in była w całości zbudowana z drzewa cedrowego - budynek wzniesiono tu w 594 r. a przebudowano, pozostawiając jednak starą strukturę, w XVII wieku. Japońska policja bada obecnie przyczyny pożaru - podejrzewa się rozmyślne podpalenie.