Pompy chłodzące reaktor zatrzymały się w sobotę wieczorem, a temperatura zbiornika i reaktora rosła. Problem odkrył pracownik elektrowni w sobotę o 21 czasu lokalnego. Temperatura reaktora wynosiła wtedy 68 stopni Celsjusza. W niedzielę wzrosła ona do 92 stopni Celsjusza. Ok. godziny 13 czasu lokalnego system chłodzenia został ponownie uruchomiony, dzięki czemu temperatura reaktora powinna wkrótce spaść. Spółka TEPCO bada obecnie przyczyny awarii pomp. Firma nie informowała o problemie do niedzieli rano czasu lokalnego, przekazała jedynie informacje rządowi i władzom lokalnej prefektury. Rzecznik TEPCO przeprosił później za tę zwłokę. Reaktory nr 5 i nr 6, w przeciwieństwie do czterech pozostałych znajdujących się w Fukushimie I, nie uległy poważnemu uszkodzeniu w następstwie katastrofalnego trzęsienia ziemi i tsunami z 11 marca. Jest to najpoważniejsza awaria nuklearna na świecie od czasu wybuchu reaktora w Czarnobylu w 1986 roku.