W rzymskich katakumbach św. Kaliksta są groby papieży z III wieku. Papieże są chowani nie tylko w Grotach Watykańskich, ale także nad posadzką, czyli w samej w bazylice św. Piotra. Czasem papieży pochowanych pod bazyliką przenoszono do innych kościołów. Zdarzało się, że szczątki papieży wracały do Rzymu po kilkuset latach. W 868 roku święci bracia Cyryl i Metody przywieźli szczątki zmarłego męczeńską śmiercią i pochowanego na Krymie świętego Klemensa, czwartego w kolejności papieża. Niektórych papieży pochowano poza Rzymem: np. Wiktor II spoczywa w kościele w Rawennie, Mikołaj II w kościele we Florencji, a Lucjusz II w katedrze w Weronie. Pochodzący z Niemiec Klemens II został pochowany w katedrze w Bambergu, a we Francji pochowani są papieże z okresu niewoli awiniońskiej. Zobacz raport specjalny "Jan Paweł II"