Zaledwie dzień przed atakami specjalna komisja amerykańskiego kongresu wskazała na Filipiny jako na kraj, w którym działają współpracownicy saudyjskiego terrorysty Osamy bin Ladena, podejrzewanego o zorganizowanie wtorkowych zamachów na USA. Także na Filipinach, i to w tym samym hotelu w Manilli, zatrzymano przed sześcioma laty jednego ze sprawców pierwszego zamachu na World Trade Center.