Tuż po przyjeździe do Fatimy papież, witany przez dziesiątki tysięcy wiernych, udał się do sanktuarium, gdzie znajduje się figura Matki Bożej, w koronie której z woli Jana Pawła II umieszczono kulę z pistoletu zamachowca Alego Agcy. - Czcigodny Jan Paweł II, który odwiedził Cię trzy razy tu w Fatimie i podziękował za tę niewidzialną rękę, która ocaliła go przed śmiercią 13 maja na Placu świętego Piotra prawie 30 lat temu, podarował sanktuarium w Fatimie kulę, jaka zraniła go ciężko; została ona umieszczona w Twojej koronie, Królowo Pokoju - mówił Benedykt XVI w modlitwie maryjnej. - Głęboką pociechą jest świadomość, że jesteś ukoronowana nie tylko srebrem i złotem naszych radości i nadziei, ale także kulą naszych trosk i cierpień - dodał papież. Przypomina się, że dokładnie 10 lat temu, 12 maja 2000 roku, podczas swej ostatniej wizyty w tym miejscu polski papież w symbolicznym geście położył u stóp posągu pierścień od kardynała Stefana Wyszyńskiego, który Prymas Tysiąclecia podarował mu po jego wyborze w 1978 roku. Na pierścieniu znajdował się napis "Totus tuus". Papież modlił się o odnowę Kościoła Benedykt XVI dokonał w środę w Fatimie aktu zawierzenia Matce Bożej wszystkich kapłanów. Modlił się o "odnowę Kościoła" oraz o to, by księża nie lekceważyli swego powołania i nie ulegali "egoizmowi oraz pochlebstwom świata i podszeptom Złego". Papieskie nieszpory dla duchowieństwa w kościele Przenajświętszej Trójcy w portugalskim miasteczku, gdzie znajduje się słynne sanktuarium maryjne, były dedykowane obchodom Roku Kapłańskiego. Na ich zakończenie papież wygłosił słowa modlitwy do Matki Bożej, prosząc: "Przybądź nam na pomoc i uwolnij od wszelkiego niebezpieczeństwa, które nam grozi". Benedykt XVI modlił się: - Niech Twoja obecność sprawi, że rozkwitnie pustynia naszej samotności i rozbłyśnie słońce nad naszymi mrokami, niech sprawi, że powróci cisza po burzy. Wcześniej w homilii papież przypomniał, że zadaniem każdego kapłana jest "wierność i lojalność wobec swego powołania". Do seminarzystów zaapelował o to, aby świadomi wielkiej odpowiedzialności, jaką podejmują, "dobrze sprawdzili swe zamiary i motywacje". Papież spotkał się z premierem Socratesem Środowe spotkanie z socjalistycznym premierem Portugalii Jose Socratesem było ostatnim ważnym punktem wizyty Benedykta XVI w Lizbonie przed odlotem do Fatimy. Po swej półgodzinnej rozmowie z Benedyktem XVI portugalski premier poinformował dziennikarzy, że jej głównym tematem były "znakomite stosunki" między Kościołem i państwem. - Miałem okazję położyć nacisk przed Jego Eminencją na znaczenie instytucji Kościoła w naszym kraju, zwłaszcza w rozwoju polityki społecznej - mówił lider portugalskich socjalistów. Wyraził przekonanie, że bardzo ważne, aby odpowiedzieć na wszystkie wyzwania społeczne, jest połączenie wysiłków państwa i Kościoła. Dziennikarze zauważyli, że premier kilka razy mówiąc o papieżu użył sformułowania "eminencja", które stosuje się w odniesieniu do kardynałów. Nie wiadomo, czy tak samo zwracał się również do Benedykta XVI w trakcie rozmowy z nim.