W wyniku pożaru w maju 2006 r. spłonął dach świątyni. W pomoc w odbudowie kościoła włączyło się Ministerstwo Kultury i Dziedzictwa Narodowego. Podczas środowego spotkania w resorcie Jarosław Sellin podsumował dotychczasowe przedsięwzięcia służące odbudowie kościoła św. Katarzyny w Gdańsku, dotkniętego pożarem. Przypomniał, że w 2006 r., w pierwszym etapie remontu minister Kazimierz Michał Ujazdowski przyznał kwotę 1 mln 300 tys. zł. Minister objął też patronatem dwa koncerty zorganizowane pod hasłem "Połóż swoją dachówkę". Koncerty "Pasji według św. Mateusza" Jana Sebastiana Bacha w wykonaniu solistów, chóru Muenster Bach oraz monachijskiej orkiestry Bach Collegium pod batutą Hansjorga Albrechta odbyły się w marcu 2007 r. w gdańskim kościele św. Brygidy oraz w warszawskiej Filharmonii Narodowej. Dochód ze sprzedaży "biletów-dachówek" w wysokości 55 tys. zł został przeznaczony na odbudowę kościoła. W tym roku kościół św. Katarzyny otrzymał od resortu ponad 800 tys. zł. Sellin zapewnił, że pomoc ministerstwa w odbudowie gdańskiej świątyni będzie "ciągła". - Chcemy, by ten kościół wypiękniał w całości. Chodzi nie tylko o odbudowę murów czy dachu, ale także o konserwację zabytków ruchomych - podkreślił. Dodał, że w planowane jest także stworzenie - tuż pod odbudowanym dachem kościoła - gdzie jest duża niezagospodarowana przestrzeń - muzeum Jana Heweliusza. - Jan Heweliusz - ten najsłynniejszy polski astronom, obok Mikołaja Kopernika - jest pochowany w kościele św. Katarzyny - przypomniał Sellin. Kościół pw. św. Katarzyny - najstarszy kościół parafialny gdańskiej Starówki - został wzniesiony w latach 1227-1239 i został znacznie rozbudowany w XIV wieku. ożar dachu kościoła św. Katarzyny w Gdańsku wybuchł 22 maja 2006 r. Płomienie miały wysokość kilkunastu metrów ponad poszycie dachu. W ciągu kilkunastu minut konstrukcja zawaliła się. Szczątki dachu spadły na betonowy strop, który przetrwał i ochronił wnętrze świątyni przed ogniem. Strażakom udało się też uratować wieżę kościoła wraz ze znajdującym się w niej zabytkowym carillonem.