Pierwszym etapem pielgrzymki, rozpoczynające się 24 maja będzie stolica Jordanii, Amman. Papież zostanie przyjęty w Pałacu Królewskim przez króla Abdullaha II i jego żonę Ranię. Następnie odprawi mszę na stadionie. Wieczorem uda się do miejsca chrztu Jezusa w Betanii nad rzeką Jordan. W miejscowym kościele spotka się z uchodźcami i niepełnosprawnymi. W niedzielę 25 maja Franciszek odleci z Ammanu do Betlejem na terenie Autonomii Palestyńskiej. Tam zostanie przyjęty przez szefa jej władz Mahmuda Abbasa. Po spotkaniu z władzami palestyńskimi papież odprawi mszę na Placu Żłóbka. Obiad zje z palestyńskimi rodzinami w klasztorze franciszkanów w Betlejem. Później złoży prywatną wizytę w Grocie Narodzenia Pańskiego, a także spotka się z dziećmi z obozów dla uchodźców. Wieczorem Franciszek przybędzie do Jerozolimy, gdzie jeszcze tego dnia przeprowadzi rozmowę z ekumenicznym patriarchą Konstantynopola Bartłomiejem I. Następnie w bazylice Grobu Pańskiego razem wezmą oni udział w uroczystości upamiętniającej 50. rocznicę pierwszego po wiekach schizmy historycznego spotkania papieża Pawła VI i prawosławnego patriarchy Atenagorasa. Trzeci i ostatni dzień podróży Franciszek rozpocznie od wizyty u wielkiego muftiego Jerozolimy. Będzie też przy Ścianie Płaczu i uda się do jerozolimskiego Instytutu Pamięci o Holokauście Yad Vashem. Kolejne punkty napiętego programu tego dnia to spotkanie papieża z dwoma naczelnymi rabinami Izraela, z prezydentem kraju Szimonem Peresem, z premierem Benjaminem Netanjahu. Po południu w kościele Getsemani przy Gaju Oliwnym Franciszek spotka się z duchowieństwem. Na zakończenie wizyty odprawi mszę w Wieczerniku. Wieczorem papież odleci z Tel Awiwu do Rzymu.