Spocząć mają tam doczesne szczątki wszystkich pochowanych na terenie diecezji biskupów tarnowskich. - Katedra jest kościołem własnym biskupa. Kiedy nie było krypty, pasterze Kościoła tarnowskiego byli chowani w rożnych miejscach. Dlatego zastanawiamy się, czy w przyszłości ich szczątki nie powinny spocząć w bazylice katedralnej- wyjaśnił ordynariusz tarnowski, biskup Wiktor Skworc. Grobowce dla biskupów tarnowskich powstają w krypcie pod nawą północną. W podziemiach katedry spoczywają obecnie tylko dwaj biskupi kościoła tarnowskiego: arcybiskup Jerzy Ablewicz i biskup Józef Wojtarowicz. To właśnie abp Ablewicz w drugiej połowie XX wieku zwrócił uwagę na problem braku grobowców dla biskupów tarnowskich i polecił przygotować odpowiednie miejsce pochówku. Po przygotowaniu krypty, pierwszy spoczął w niej bp Wojtarowicz, zmarły w 1875 roku i pochowany w Krakowie na Cmentarzu Rakowickim. W 100.rocznicę jego śmierci nastąpiła ekshumacja i uroczyste przeniesienie zwłok do tarnowskiego kościoła. W 1990 roku w tej samej krypcie został pochowany sam pomysłodawca krypty biskupów tarnowskich, abp Jerzy Ablewicz. Diecezja tarnowska została utworzona w 1783 roku. Biskup Wiktor Skworc jest piętnastym ordynariuszem w jej historii. W podziemiach bazyliki katedralnej spoczywają arcybiskup Jerzy Ablewicz i biskup Józef Wojtarowicz. Na tarnowskim Starym Cmentarzu są pochowani: bp Florian Janowski, bp Ignacy Łobos oraz bp Józef Pukalski. Arcybiskup Leon Wałęga spoczywa przy klasztorze w Tuchowie, a bp Franciszek Lisowski na nowym cmentarzu w Tarnowie. Grób bpa Jana Stepy znajduje się w kościele św. Józefa i Matki Bożej Fatimskiej w Tarnowie. Biskup nominat Jan Duwall został pochowany w 1785 roku na cmentarzu klasztornym ojców bernardynów naprzeciwko wielkich drzwi kościoła i dziś nie można wskazać dokładnie miejsca jego grobu. Natomiast biskupi Tomasz Ziegler, Ferdynand Chotek, Franciszek Pisztek, Franciszek Zachariasiewcz spoczywają w innych diecezjach, do których zostali nominowani z Tarnowa.