Interesował się przede wszystkim miejscami związanymi z Janem Pawłem II. Wizytą w Krakowie zakończył się kilkudniowy pobyt prezydenta w Polsce. Do postaci Jana Pawła II prezydent nawiązywał zarówno podczas wizyty na Uniwersytecie Jagiellońskim, jak i podczas zwiedzania Katedry Wawelskiej i rozmowy z metropolitą krakowskim kard. Stanisławem Dziwiszem. Napisał o nim także w księdze pamiątkowej. Kard. Dziwisz zaprosił prezydencką parę, by przyjechali do Krakowa ponownie jako turyści. Głównym punktem wizyty prezydenta Portugalii w Krakowie było podpisanie protokołu o współpracy pomiędzy portugalskim Instytutem Camoesa i Uniwersytetem Jagiellońskim. W ramach tej współpracy na UJ utworzona zostanie katedra Vergilio Ferreira. Protokół został podpisany przez rektora Uniwersytetu Jagiellońskiego prof. dr hab. Karola Musioła oraz wiceprezesa Instytutu Camoesa Miguela Fialhodebrito. Katedra Vergilio Ferreira będzie rozpowszechniać język i kulturę krajów należących do Wspólnoty Krajów Języka Portugalskiego (CPLP). Umożliwi atrakcyjną formę kształcenia naukowego i pedagogicznego dla wykładowców oraz studentów portugalistyki, m.in. zapewniając stypendia oraz organizując wyjazdy na staże do Portugalii. W ramach współpracy Instituto Camoes przez 3 lata będzie przekazywać UJ coroczną subwencję na działalność katedry oraz udostępni wyspecjalizowaną bibliotekę, w której zgromadzone są zbiory z zakresu języka portugalskiego. Prezydencka para zwiedziła także Bazylikę Mariacką i Rynek Główny w Krakowie, na którym została obdarowana bukietem kwiatów przez krakowskie kwiaciarki. W Katedrze Wawelskiej, po której oprowadzał gości kard. Stanisław Dziwisz, prezydent interesował się ołtarzem św. Stanisława i sarkofagami królów. Na specjalne życzenie zwiedził groby królewskie i kryptę św. Leonarda, w której swoją mszę prymicyjną odprawił ks. Karol Wojtyła. - Z miłością przyszedłem tu na Wawel, żeby znaleźć ślady Jana Pawła II - powiedział Cavaco Silva dziennikarzom po zakończeniu kilkudziesięciominutowej rozmowy z kard. Dziwiszem. Podkreślił wielką rolę Jana Pawła II w przemianach, jakie dokonały się za jego pontyfikatu w Europie, szczególnie politycznych, polegających na obaleniu marksizmu i wskazaniu, że przyszłość należy do praw człowieka, do praw narodów i solidarności międzyludzkiej. - Powiedziałem panu prezydentowi, że Portugalia stała się nam bliższa po zamachu na Ojca Świętego. W diecezji krakowskiej zostały wybudowane kościoły ku czci Matki Boskiej Fatimskiej za ocalenie Jana Pawła II. Pamiętamy, że Ojciec Święty w rok po zamachu pojechał do Fatimy podziękować Matce Boskiej za uratowanie go i tam zostawił kulę, która go ugodziła - powiedział po spotkaniu kard. Dziwisz. Jak dodał metropolita, prezydent Cavaco Silva był bardzo zainteresowany historią katedry i Krakowa, interesował się śladami polskiego papieża i miał dużo wspomnień związanych z wizytą Jana Pawła II w Portugalii. - Pan prezydent był pod wrażeniem Wawelu jako kompleksu historycznego i architektonicznego. Widziałem, że przeżył mocno wizytę w Katedrze, gdzie mówią wieki, oraz wędrówkę śladami Jana Pawła II. Zaprosiłem pana prezydenta, żeby jeszcze kiedyś przyjechał nieoficjalnie, jako turysta - powiedział kardynał.