Koszt inwestycji wyniesie 57,5 mln zł, z czego 40,2 mln zł stanowić będzie dofinansowanie ze środków unijnych w ramach Regionalnego Programu Operacyjnego, a 17,4 mln to środki z budżetu państwa. Drugi etap tworzenia Regionalnego Centrum Innowacyjności jest stopniowo realizowany od jesieni 2009 r. Projekt przewiduje utworzenie kompleksu doskonale wyposażonych laboratoriów specjalistycznych, które będą mogły stanowić zaplecze badawcze przede wszystkim dla firm regionu kujawsko-pomorskiego. W ramach przedsięwzięcia modernizowane i adaptowane są istniejące obiekty wszystkich jednostek uczelni, które są wyposażane w nowoczesne urządzenia. Lista zakupów urządzeń obejmuje łącznie ponad 800 pozycji. Dotychczas powstało 12 laboratoriów na 11 wydziałach uniwersytetu. Są to laboratoria m.in.: badania własności mechanicznych oraz składu chemicznego materiałów konstrukcyjnych, badania żywności i urządzeń przemysłu spożywczego, badania urządzeń elektrycznych niskiego napięcia i jakości produkcji, komputerowego wspomagania projektowania, badania konstrukcji drogowych, genetyki molekularnej. Pierwszy etap budowy Regionalnego Centrum Innowacyjności przeprowadzono w latach 2005-2007, gdy wzniesiono i wyposażono część dydaktyczną ośrodka. Koszt inwestycji wyniósł 22 mln zł, z czego 75 proc. pochodziło z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego, a pozostałe środki z budżetu państwa, województwa i miasta.