Takie m.in. informacje znajdują się w raporcie historyków o inwigilacji Kościoła krakowskiego przez komunistyczną służbę bezpieczeństwa. Do dokumentu dotarli dziennikarze radia RMF. W rozmowie z RMF ks. Maliński powiedział tylko, że "nie było współpracy". Przeczytaj cały wywiad: "Ks. Maliński dla RMF: Nie było współpracy" Według opinii historyków Instytutu Pamięci Narodowej, "Delta" przekazywał SB informacje na temat kardynałów Stefana Wyszyńskiego i Karola Wojtyły, a także innych znanych duchownych i działaczy katolickich, zarówno z Polski, jak i tych, których Maliński spotykał podczas podróży zagranicznych. Raport potwierdza również, że po 1989 roku zawartość teczki tajnego współpracownika "Delta" została zniszczona, ale zachowane nieliczne dokumenty dają pewność, że ksiądz Mieczysław Maliński przez wiele lat współpracował z komunistyczną bezpieką. Według dyrektora krakowskiego IPN prof. Ryszarda Terleckiego, z dokumentów IPN wynika, że ks. Mieczysław Maliński współpracował z SB, choć w zachowanych archiwaliach nie ma podpisanego przez niego zobowiązania do współpracy. - Jeśli chodzi o Malińskiego, mamy puste tekturowe teczki, w których ktoś zostawił, nie wiadomo czy przypadkowo, czy celowo parę dokumentów. Czy to jest manipulacja? Ja osobiście nie bardzo w to wierzę. Raczej był jakiś chaos w działalności bezpieki. Z tego co mamy, wynika niezbicie, że kilkakrotnie w różnych okresach współpracował z bezpieką - mówił Terlecki. Autor rozdziału poświęconego ks. Malińskiemu, Marek Lasota pisze, że w teczce personalnej z 1971 r. tajnego współpracownika o pseud. Delta zachował się kwestionariusz osobowy z danymi ks. Malińskiego i uzasadnieniem, że powinien on zostać pozyskany do współpracy, bo ma możliwość dotarcia m.in. do Karola Wojtyły, niektórych biskupów i profesorów. - Mogę powiedzieć, że wszystko to, co napisał pan Marek Lasota jest zgodne z prawdą. Czytałem dokładnie te same dokumenty i w mojej książce piszę dokładnie to samo. Nie ma cienia wątpliwości, że ksiądz Maliński to tajny współpracownik SB, TW Delta- mówi ksiądz Isakowicz- Zaleski. Dodajmy, że raport "Kościół katolicki w czasach komunistycznej dyktatury" pojutrze opublikuje wydawnictwo jezuitów WAM.