Oficjalną decyzję o starcie w listopadowych wyborach samorządowych Małkowski ogłosił w poniedziałek na konferencji prasowej. Zapowiedział, że będzie kandydował na stanowiska prezydenta Olsztyna i radnego. Przedstawił również popierający go Komitet Wyborczy Wyborców Czesława Jerzego Małkowskiego, który wystawi kandydatów do rady miejskiej. B. prezydent Olsztyna jest oskarżony o gwałt na urzędniczce i przestępstwa o charakterze seksualnym wobec trzech innych kobiet, a także nadużycie stosunku zależności wobec nich i uporczywe naruszanie praw pracowniczych. Proces w tej sprawie toczy się od trzech lat przed Sądem Rejonowym w Ostródzie. Oskarżony twierdzi, że jest niewinny. Małkowski stracił fotel prezydenta Olsztyna w 2008 roku w wyniku referendum po wybuchu tzw. seksafery. W ostatnich wyborach samorządowych ubiegał się o powtórny wybór, ale przegrał w drugiej turze z Piotrem Grzymowiczem. Obecnie jest miejskim radnym.