Biolodzy z University of uważają, że zmiany kształtu głowy psów tej rasy na przestrzeni wielu lat można wyjaśnić tylko w oparciu o teorię ewolucji i selekcji naturalnej. Zespół doktora Chrisa Klingenberga zbadał czaszki 47 ze zbiorów muzeum historii naturalnej w Bernie - najstarsze pochodziły sprzed 120 lat, gdy po raz pierwszy zdefiniowano tę rasę. Okazało się, że z biegiem lat cechy uznane za typowe dla rasy stawały się coraz bardziej uwydatnione, ponieważ hodowcy wybierali do rozmnażania psy najlepiej odpowiadające tym warunkom. Pozwoliło to naukowcom obserwować zmiany ewolucyjne pod wpływem dobrze zdefiniowanej presji selekcyjnej. Współczesne bernardyny mają szersze czaszki, kąt pomiędzy nosem i czołem jest u nich mniejszy niż niegdyś, a części kostne nad oczami bardziej wystające.